小儿消化不良的诊断标准：
有消化不良症状至少2个月，每周至少出现1次，并符合以下3项条件：
- 持续或反复发作的上腹部(脐上)疼痛或不适、早饱、嗳气、恶心、呕吐、反酸；
- 症状在排便后不能缓解，或症状发作与排便频率或粪便性状的改变无关(即除外肠易激综合征)；
- 无炎症性、解剖学、代谢性或肿瘤性疾病的证据可以解释患儿的症状。
小儿消化不良是一种功能性病变，各种实验室检查、放射学和内镜检查往往无阳性发现。近年来，随着胃电图、胃动力试验的开展和应用，其辅助诊断方法有了许多新进展。
1. 体表胃电图检查
这是一种非侵入性的评估患儿不良胃肌电活动的有效手段。应用体表胃电及富里叶转换和频谱分析方法可以测定胃窦移动性运动复合波(MMC)。研究表明部分小儿消化不良患儿胃窦移动性运动复合波活动明显减少。小儿消化不良患儿胃动过缓比较多见，而食欲减退的患儿胃窦电活动亢进更多见，说明胃电图检查可以提示胃平滑肌的不良运动(亢进或减慢)，对儿童小儿消化不良有辅助诊断意义。
2. 胃动力检测
胃感觉运动功能障碍是小儿消化不良的发病机制之一，大部分患儿有胃动力异常。胃动力检测法通过超声了解胃排空情况，观察胃窦收缩频率、幅度，为临床诊断小儿消化不良提供客观依据，并可在随访过程中对疗效进行评估。此检测方法具有无痛性、无创性、经济、简便、避免射线照射等优点，患儿及家长易于接受。但检查需要患儿配合，<3岁的小儿认知能力不足。较难执行。
3．其他
水负荷试验协助诊断小儿消化不良，其特异性高，但敏感性低，且尚未广泛应用于临床。许多小儿消化不良患儿伴有焦虑、紧张、抑郁等心理因素，通过简单的心理测试，可以了解患儿的心理健康状况，进一步了解患儿病情，从而协助诊断和治疗。
